La Democracia Cristiana Universitaria nace en la década de 1960 en las Universidades de Chile y Universidad Católica para apoyar la candidatura y posterior gobierno del ex Presidente Eduardo Frei Montalva. 

Desde esta base universitaria se comenzaron a gestar importantes cambios en la transformación de las Universidades chilenas. 

Pronto se comenzaron a gestar distintas DCU a lo largo del país como en la Universidad de Concepción, Universidad Católica de Valparaíso, etc.

 Un hito importante en la Historía de la Democracia Cristiana Universitaria fue la Toma de la Casa Central de la Pontificia Universidad Católica de Chile el 11 de Agosto de 1967 e inicia el proceso de la Reforma Universitaria, que años despues sería anulada por la dictadura de Augusto Pinochet, apoyado por el Movimiento Gremial fundado por  Jaime Guzmán.

 Durante la dictadura se prohibió las actividades políticas, designando a estudiantes ligados a la dictadura para ejercer los cargos en las distintas Federaciones de estudiantes. Pero la DCU continuo trabajando en la clandestinidad, junto a muchos otros movimientos opositores al régimen, en la defensa de los Derechos Humanos y en la lucha para la recuperación de la democracia en las universidades chilena.

A mediados de los 80, y frente a la presión de distintos movimientos democráticos, la DCU gana las elecciones en la Federación de Estudiantes de la Universidad de Chile con Yerko Ljubetic en 1984 y en la Universidad Católica con Tomás Jocelyn-Holtz en 1985. Dado el fuerte trabajo de la DCU, se mantiene presidiendo las principales Federaciones de Chile hasta a mediados de la década de 1990, de los que se cuentan:

- Humberto Burotto (Fech 1985)

- Germán Quintana (Fech 1986 y 1987)

- Alex Figueroa (Feuc 1987)

-Patricio Zapata (Feuc 1988)

- Andrés Lastra (Fech 1988)

- Claudio Orrego (Feuc 1990)

- Manuel Inostroza (Fech 1990 y 1991)

- Clemente Pérez (Feuc 1991)

- Alberto Undurraga (Feuc 1992)

- Enrique Álvarez (Feuc 2002)

A partir de 2009/2010 la Democracia Cristiana ha comenzado, con el apoyo de la Juventud Demócrata Cristiana y distintos militantes DC que pertenecieron a este movimiento tales como Laura Albornoz, Ignacio Walker, Fuad Chahin y muchos otros, lo que ha permitido obtener representación estudiantil en la Universidad de

 Magallanes, Federico Santa María, La Serena, y en la históricas Universidad de Chile y Pontificia Universidad Católica de Valparaíso..